卫生署母婴健康院与医院管理局辖下的产科部门一直紧密合作，为妇女提供连贯的产前和产后服务。而且大多数本地出生的婴儿会在出院后首数天，来访母婴健康院接受服务。因此，母婴健康院亦意向成为「爱婴医疗机构」，一起支援家长开始和持续喂哺母乳。

卫生署遂於2016 年 6 月，在其中三间母婴健康院推行「爱婴母婴健康院」先导计划。

于先导计划下获定名的三间「爱婴母婴健康院」分别为：

• 九龙城母婴健康院
• 西营盘母婴健康院
• 油麻地母婴健康院

由于先导计划的成效理想，「爱婴母婴健康院」认证计划的工作已在2021年3月于另外五间母婴健康院展开，包括：

• 蓝田母婴健康院
• 马鞍山母婴健康院
• 北葵涌母婴健康院
• 西湾河母婴健康院
• 天水围母婴健康院

另外，「爱婴母婴健康院」认证计划的工作亦在 2022 年 11 月於以下七间母婴健康院展开，包括：

• 粉岭母婴健康院
• 梅窝母婴健康院
• 邓志昂母婴健康院
• 屯门湖康母婴健康院
• 东涌母婴健康院
• 西九龙母婴健康院
• 仁爱母婴健康院

随後，「爱婴母婴健康院」认证计划的工作也在 2023 年 10 月於以下十三间母婴健康院展开，包括：

• 柏立基夫人母婴健康院
• 鸭脷洲母婴健康院
• 柴湾母婴健康院
• 长洲母婴健康院
• 东九龙母婴健康院
• 观塘母婴健康院
• 沥源母婴健康院
• 元朗容凤书母婴健康院
• 柏立基母婴健康院
• 将军澳宝宁路母婴健康院
• 青衣母婴健康院
• 荃湾母婴健康院
• 王少清母婴健康院

有关「爱婴母婴健康院」认证计划的最新进展可浏览：https://www.babyfriendly.org.hk/zh/healthcare-facilities-zh/