兒童健康服務
母嬰健康院推行幼兒健康及發展綜合計劃，以促進兒童的全人健康，包括生理、認知、情緒和社交方面的發展。綜合計劃的核心項目有親職教育、免疫接種和健康及發展監察。
親職教育
親職教育計劃目的是協助所有到訪母嬰健康院幼兒的家長，對子女的成長發展有更多認識，從而更有信心地扶育幼兒健康地成長。健康院會透過派發資料單張、收聽預錄育兒常見問題、舉辦公眾健康講座及親職活動(以廣東話進行)、網上資源和提供個別輔導，從妊娠期開始到整個兒童學前階段，為所有家長提供有關兒童身心發展、育兒知識(例如：母乳餵哺、嬰幼兒飲食及營養、家居安全、口腔健康等)及親職輔導。如果兒童有初期的行為問題或父母在管教方面遇到困難，家長可參加「3P親子正策課程」(以廣東話進行)。
免疫接種
母嬰健康院是按照「香港兒童免疫接種計劃」為初生至五歲的嬰幼兒童提供免疫接種服務。
健康及發展監察
專業的醫護人員定期跟進兒童的成長及發展，以便及早發現有問題的兒童及作出轉介。醫護人員會為新生嬰兒進行身體檢查，定期監察兒童的生長指標，並於特定年齡為兒童進行正規的聽力及視力普查測試。健康院亦會與家長協作，為兒童進行發展監察，包括提高家長對兒童發展的關注，共同觀察兒童的表現，及為家長提供適切指導。若懷疑兒童的健康或成長發展有異常情況，母嬰健康院會轉介兒童到專科診所作進一步診治及跟進。